python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的

python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的，相信很多沒有經(jīng)驗的人對此束手無策，為此本文總結(jié)了問題出現(xiàn)的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。

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 直接使用pip進行安裝
pip install dna_features_viewer
 
python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的  
image.png
python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的  
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可以提供gff 格式 或者 genbank 格式 注釋文件，也可以手動輸入 基因各個特征的位置

 試著運行其中的一個例子
python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的  
image.png
from dna_features_viewer import GraphicFeature, GraphicRecord
features=[
    GraphicFeature(start=0, end=20, strand=+1, color="#ffd700",
                   label="Small feature"),
    GraphicFeature(start=20, end=500, strand=+1, color="#ffcccc",
                   label="Gene 1 with a very long name"),
    GraphicFeature(start=400, end=700, strand=-1, color="#cffccc",
                   label="Gene 2"),
    GraphicFeature(start=600, end=900, strand=+1, color="#ccccff",
                   label="Gene 3")
]
record = GraphicRecord(sequence_length=1000, features=features)
record.plot(figure_width=5)
 

這里遇到的問題是如何將圖片保存下來呢？

可視化展示還有其他更豐富的功能，有時間再來探索

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

主要分享：1、R語言和python做數(shù)據(jù)分析和數(shù)據(jù)可視化的簡單小例子；2、園藝植物相關(guān)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、群體遺傳學(xué)文獻閱讀筆記；3、生物信息學(xué)入門學(xué)習(xí)資料及自己的學(xué)習(xí)筆記！

接下來是為了湊字數(shù)申請原創(chuàng)的一些內(nèi)容 

這個鏈接有許多關(guān)于python 做生物信息的內(nèi)容，其中有一個簡易版本的基因組瀏覽器，爭取把代碼實現(xiàn)一遍

http://dmnfarrell.github.io/

python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的  

看完上述內(nèi)容，你們掌握 python里用來畫基因結(jié)構(gòu)的模塊是怎樣的的方法了嗎？如果還想學(xué)到更多技能或想了解更多相關(guān)內(nèi)容，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，感謝各位的閱讀！

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