Ubuntu+python如何將nii圖像保存成png格式-創(chuàng)新互聯(lián)

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系統(tǒng):Ubuntu 16.04

軟件: python 3.5

先用pip安裝nibabel、numpy、imageio、os。

import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
 
def read_niifile(niifile):   #讀取niifile文件
 img = nib.load(niifile)   #下載niifile文件(其實(shí)是提取文件)
 img_fdata = img.get_fdata()  #獲取niifile數(shù)據(jù)
 return img_fdata
 
def save_fig(file):     #保存為圖片
 fdata = read_niifile(file)  #調(diào)用上面的函數(shù),獲得數(shù)據(jù)
 (x,y,z) = fdata.shape   #獲得數(shù)據(jù)shape信息:(長(zhǎng),寬,維度-切片數(shù)量)
 for k in range(z):
  silce = fdata[k,:,:]   #三個(gè)位置表示三個(gè)不同角度的切片
  imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
          #將切片信息保存為png格式
 
dir = './.nii'      #nii的路徑
savepicdir = ''      #保存png的路徑
os.mkdir(savepicdir)     #創(chuàng)建文件夾
save_fig(dir)      #運(yùn)行程序,保存為圖像

不要忘記返回img_fdata,否則下一個(gè)文件會(huì)報(bào)錯(cuò)。

以上是“Ubuntu+python如何將nii圖像保存成png格式”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助,如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí),歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道!

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