circ2Traits數(shù)據(jù)庫有什么用

這篇文章主要為大家展示了“circ2Traits數(shù)據(jù)庫有什么用”，內(nèi)容簡(jiǎn)而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領(lǐng)大家一起研究并學(xué)習(xí)一下“circ2Traits數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章吧。

創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站建設(shè)公司一直秉承“誠(chéng)信做人，踏實(shí)做事”的原則，不欺瞞客戶，是我們最起碼的底線！ 以服務(wù)為基礎(chǔ)，以質(zhì)量求生存，以技術(shù)求發(fā)展，成交一個(gè)客戶多一個(gè)朋友！專注中小微企業(yè)官網(wǎng)定制，網(wǎng)站制作、成都網(wǎng)站設(shè)計(jì)，塑造企業(yè)網(wǎng)絡(luò)形象打造互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)效應(yīng)。

miRNA的研究起步很早，miRNA與疾病相關(guān)的文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫也相對(duì)成熟，而circRNA作為最近興起的一種RNA, 可以作為miRNA  sponger與miRNA結(jié)合， 發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后調(diào)控功能。

circ2Traits是一個(gè)環(huán)狀RNA相關(guān)的疾病或者特殊性狀的數(shù)據(jù)庫，通過分析環(huán)狀RNA與那些疾病相關(guān)的miRNA的相互作用，從而在環(huán)狀RNA和疾病之間建立起關(guān)聯(lián)。同時(shí)為了進(jìn)一步分析環(huán)狀RNA在疾病中的調(diào)控路徑，還構(gòu)建了circRNA的ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)址如下

http://gyanxet-beta.com/circdb/

數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建需要依賴以下4種信息，對(duì)應(yīng)的來源描述如下

1. 從miR2disease數(shù)據(jù)庫得到疾病相關(guān)的miRNA信息

2. 從Memzcak等人的研究中得到環(huán)狀RNA與miRNA的相互作用關(guān)系

3. 從starBase數(shù)據(jù)庫得到miRNA-mRNA的相互作用信息

4. 從miRCode數(shù)據(jù)庫得到miRNA和lncRNA的相互作用信息

目前官網(wǎng)只提供了數(shù)據(jù)下載的功能，示意如下

第一個(gè)文件是ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)信息，內(nèi)容示意如下，第一類為miRNA,第二列為protein coding或者lncRNA轉(zhuǎn)錄本，第三列為環(huán)狀RNA,第四列為疾病的名稱

第二個(gè)文件是環(huán)狀RNA的所有信息，包含了circRNA-miRNA和circRNA和miRNA結(jié)合區(qū)域的SNP信息，內(nèi)容列數(shù)很多，截取如下

通過該數(shù)據(jù)庫，可以得到疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA信息，同時(shí)其分析疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA的思路和將circRNA,ceRNA，SNP信息整合的策略都值得借鑒。

以上是“circ2Traits數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助，如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí)，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道！

文章標(biāo)題：circ2Traits數(shù)據(jù)庫有什么用
地址分享：http://bm7419.com/article26/pcogcg.html

成都網(wǎng)站建設(shè)公司_創(chuàng)新互聯(lián)，為您提供外貿(mào)網(wǎng)站建設(shè)、網(wǎng)頁設(shè)計(jì)公司、搜索引擎優(yōu)化、App開發(fā)、虛擬主機(jī)、網(wǎng)站設(shè)計(jì)

廣告

聲明：本網(wǎng)站發(fā)布的內(nèi)容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉(zhuǎn)載內(nèi)容為主，如果涉及侵權(quán)請(qǐng)盡快告知，我們將會(huì)在第一時(shí)間刪除。文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場(chǎng)，如需處理請(qǐng)聯(lián)系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內(nèi)容未經(jīng)允許不得轉(zhuǎn)載，或轉(zhuǎn)載時(shí)需注明來源： 創(chuàng)新互聯(lián)