DARNED數(shù)據(jù)庫有什么用

這篇文章給大家分享的是有關(guān)DARNED數(shù)據(jù)庫有什么用的內(nèi)容。小編覺得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個(gè)參考，一起跟隨小編過來看看吧。

成都創(chuàng)新互聯(lián)是一家專業(yè)提供臨猗企業(yè)網(wǎng)站建設(shè),專注與網(wǎng)站設(shè)計(jì)、成都網(wǎng)站建設(shè)、H5網(wǎng)站設(shè)計(jì)、小程序制作等業(yè)務(wù)。10年已為臨猗眾多企業(yè)、政府機(jī)構(gòu)等服務(wù)。創(chuàng)新互聯(lián)專業(yè)網(wǎng)絡(luò)公司優(yōu)惠進(jìn)行中。

DARNED數(shù)據(jù)庫收錄了human等多個(gè)物種的RNA編輯位點(diǎn)信息，除了最常見的A->I類型的RNA編輯外，還收錄了部分C->U的RNA編輯位點(diǎn)，網(wǎng)址如下

https://darned.ucc.ie/

該數(shù)據(jù)庫包含的物種如下

1. Human

2. Mouse

3. Drosophila

官網(wǎng)提供了三種檢索方式

1. region-based

Assembly選擇對(duì)應(yīng)的物種，然后根據(jù)Chromosome, start, end篩選對(duì)應(yīng)的染色體區(qū)域上的RNA編輯位點(diǎn)信息，通過Limit，可以篩選特定基因區(qū)域，比如exon上的編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

2. gene-based

gene-based支持直接檢索某個(gè)基因上的RNA編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

3. sequence-based

sequence-based支持直接輸入一段序列，首先確定該序列在基因上的位置，然后給出對(duì)應(yīng)區(qū)間的RNA編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

以human基因AHR為例，檢索結(jié)果如下

在檢索結(jié)果中，會(huì)給出每個(gè)RNA編輯位點(diǎn)的類型，染色體位置，對(duì)應(yīng)的基因，SNP, 是否位于Alu重復(fù)序列上等信息。

該數(shù)據(jù)庫是免費(fèi)下載的，可以從以下鏈接下載到各個(gè)物種的RNA編輯位點(diǎn)信息

https://darned.ucc.ie/download/

相比RADATR數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫中收錄的RNA編輯位點(diǎn)數(shù)量會(huì)少一些。

感謝各位的閱讀！關(guān)于“DARNED數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助，讓大家可以學(xué)到更多知識(shí)，如果覺得文章不錯(cuò)，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！

本文題目：DARNED數(shù)據(jù)庫有什么用
標(biāo)題路徑：http://bm7419.com/article48/jddjep.html

成都網(wǎng)站建設(shè)公司_創(chuàng)新互聯(lián)，為您提供用戶體驗(yàn)、虛擬主機(jī)、自適應(yīng)網(wǎng)站、企業(yè)網(wǎng)站制作、網(wǎng)站導(dǎo)航、網(wǎng)站營銷

廣告

聲明：本網(wǎng)站發(fā)布的內(nèi)容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉(zhuǎn)載內(nèi)容為主，如果涉及侵權(quán)請(qǐng)盡快告知，我們將會(huì)在第一時(shí)間刪除。文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場(chǎng)，如需處理請(qǐng)聯(lián)系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內(nèi)容未經(jīng)允許不得轉(zhuǎn)載，或轉(zhuǎn)載時(shí)需注明來源： 創(chuàng)新互聯(lián)