怎么設置國內的源加快R包下載速度

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R語言在使用 install.packages()安裝package的時候，默認會在官方的源（https://cran.rstudio.com/）搜索R包，然后下載到你的電腦或者服務器上。但是官方的源并不在中國，下載速度往往會受到很大的限制，因此當我們安裝好R之后，第一步就應該是把R的安裝源修改為國內的源（也稱鏡像，Mirror）。

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修改 install.packages 的安裝源
如果你使用的是有圖形界面的RGui，選擇  Packages --> Set CRAN mirror --> China (Guangzhou)

如果你使用的是Rstudio，選擇  Tools --> Global options --> Packages
點擊Change，選擇離你所在城市最近的國內源

怎么設置國內的源加快R包下載速度


怎么設置國內的源加快R包下載速度


也可以輸入以下代碼（適合不帶圖形界面的R），直接修改  
options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))
通過 getOption("repos") 命令可以知道目前的鏡像網站是哪里的



2

修改 bioconductor 的安裝源

絕大部分的生物信息相關的R包（如DESeq2, limma, clusterProfiler）都在 bioconductor，并不在官方的源里面，所以通過 install.packages() 命令會找不到對應的R包。得使用如下命令安裝：  
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))    install.packages("BiocManager")BiocManager::install("DESeq2")

同樣，使用option命令修改bioconductor的源為國內源，就再也不用忍受bioconductor 的龜速了，代碼如下：
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")


到此，關于“怎么設置國內的源加快R包下載速度”的學習就結束了，希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學習，快去試試吧！若想繼續(xù)學習更多相關知識，請繼續(xù)關注創(chuàng)新互聯(lián)網站，小編會繼續(xù)努力為大家?guī)砀鄬嵱玫奈恼拢?/p>

當前文章：怎么設置國內的源加快R包下載速度
文章URL：http://bm7419.com/article14/jdsgde.html

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